Ученые из Университета Сан-Паулу (USP) в Бразилии и Университета штата Пенсильвания (Penn State) в США собрали образцы ротовой жидкости у 50 поросят-отъемышей с пяти крупных и мелких свиноферм в штате Сан-Паулу. По их словам, выбор животных этой возрастной группы не был случайным. Период отъема является крайне стрессовым для поросят, так как в это время их отделяют от свиноматок и переводят на твердый рацион, что оказывает влияние на микробиоту и может привести к появлению ряда заболеваний.
Бактериальный состав образцов, собранных из ротовой полости, фекалий и с пола загона определяли путем секвенирования гена 16S рРНК и анализа при помощи статистической программы R Studio. В результате было установлено, что большая часть бактерий ротовой жидкости относится к таким типам, как фирмикуты (80,4%) и протеобактерии (7,7%). Наиболее распространенными видами бактерий, обнаруженными в слюне, оказались стрептококки и вейлонеллы, хотя здесь были отмечены существенные различия между фермами.
Кроме того, был проанализирован микробный состав образцов фекалий и соскобов с пола загонов. По словам ученых, это был очень важный этап, так как окружающая среда является основным источником бактерий, попадающих в полость рта поросят, и любые различия, возникающие при прохождении бактерий через организм, могут быть выявлены через анализ фекалий.
Наиболее многочисленными типами бактерий оказались фирмикуты, протеобактерии и бактероидеты, а наиболее распространенным видом стали превотеллы (Prevotella_9). В отличие от образцов ротовой жидкости, их состав был одинаковым независимо от размера фермы и применяемых процедур очистки на ферме.
По мнению исследователей, полученные результаты могут послужить основой для улучшения здоровья и продуктивности свиней. «Если вы знаете, какие микроорганизмы наиболее распространены в определенном месте, вы можете исследовать, например, маркеры здоровья полости рта или бактерии, связанные с такими заболеваниями, как инфекции желудочно-кишечного тракта или дыхательных путей, и даже с расстройствами центральной нервной системы», – отметил руководитель исследования Винициус Буятте. Его слова цитирует научный портал phys.org.
Ввиду того, что были обнаружены важные различия в бактериальном составе слюны и фекалий, следующим шагом ученые планируют изучить изменения в микробиоме кишечника поросят. Сообщается, что в настоящее время уже проводится анализ образцов из пяти различных сегментов кишечника 40 поросят.
Исследование опубликовано в журнале Scientific Reports.