C. difficile – бактерия, которая поражает кишечник человека и устойчива ко всем существующим антибиотикам, кроме трех. Некоторые штаммы содержат гены для выработки токсинов, способных вызывать воспаление в кишечнике. Оно приводит к опасной для жизни диарее, чаще всего встречается у пожилых людей и получавших антибиотики пациентов больниц.
Исследователи собрали образцы кала у 514 свиней с датских ферм. Ученые проверили кал на наличие C.difficile и при обнаружении секвенировали геном бактерий, чтобы выяснить, есть ли у обнаруженных штаммов гены для выработки токсинов. Также исследователи сравнили изоляты C.difficile с 934 изолятами, полученными от пациентов больниц, инфицированных этими бактериями.
C. difficile присутствовала в 54 образцах кала свиней, чаще оказывались заражены поросята и свиноматки. Из выделенных штаммов 13 совпали с теми, которые присутствовали в кале людей. Наиболее распространенным был штамм ST11, встречавшийся у 21 свиньи и 270 человек. В шестнадцати случаях штаммы ST11 у людей и животных были идентичны.
У всех полученных от свиней изолятов были гены для выработки токсинов. Десять из них оказались гипервирулентными. Штаммы оказались устойчивы к семи классам антибиотиков, включая макролиды и аминогликозиды.
«Чрезмерное использование антибиотиков при лечении людей и в качестве дешевого подспорья на фермах подрывает нашу способность лечить бактериальные инфекции. Это исследование предоставляет больше доказательств эволюционного давления, связанного с использованием противомикробных препаратов в животноводстве, которое отбирает опасные устойчивые патогены человека. Это подчеркивает важность более комплексного подхода к лечению инфекции C. difficile, чтобы учесть все возможные пути распространения», – отметили авторы работы.
Направление передачи инфекции, впрочем, выяснить не удалось. Некоторые штаммы в изолятах людей и животных были идентичны, и это показывает, что инфекция может передаваться от свиней к людям, от людей к свиньям или же в обе стороны. Чтобы разобраться, как именно это происходит, необходим более глубокий филогенетический анализ, отмечают ученые.
