Подробнее об этом ученые рассказывают в еще не рецензированной статье, опубликованной на сервисе препринтов bioRxiv.
Недавно появившийся вариант SARS-CoV-2 «омикрон» содержит 37 аминокислотных замен в S-белке шипа, 15 из которых находятся в рецептор-связывающем домене, пишут исследователи. Это не вызывает опасения по поводу эффективности доступных вакцин и терапевтических средств на основе антител, но и привлекает внимание к тому, откуда взялись эти мутации.
«Беспрецедентное количество замен, обнаруженных в геноме омикрон-штамма, поднимает вопросы о его происхождении», – пишут авторы.
Чтобы проверить теорию межвидовой передачи, ученые попробовали заразить вирусом клетки мыши, норки и панголина. Оказалось, омикрон-штамм успешно связывается с рецепторами клеток мышей, а вот для других животных безопасен. Предыдущие штаммы вируса были практически полностью безопасны для всех использованных в исследовании видов, отмечают ученые.
Кроме того, выяснилось, что определенные мутации омикрон-штамма повышают вероятность его связывания с клетками человека.
«В совокупности эти результаты позволяют предположить, что мутации в рецептор-связывающих доменах «омикрона» могли способствовать адаптации к грызунам, а также потенциальному повышению вероятности передачи вируса человеку», – считают авторы работы.
Помимо возможности связываться с клетками мыши вирус также научился лучше уклоняться от иммунитета и лекарств. Из 29 антител, ранее показывавших в лабораторных условиях эффективность против других штаммов, против «омикрона» ее сохранили лишь три, одно из которых имитировало активность рецептора ACE2, с которым связывается вирус. Также эффективны оказались некоторые антитела к сарбековирусам (подгруппе коронавирусов, к которой относится и SARS-CoV-2).
Версия о многократной межвидовой передаче коронавируса – лишь теория, подчеркивают авторы работы. По другой теории, «омикрон» мог возникнуть в организме человека со слабым иммунитетом и длительной инфекцией. Хотя найти причины его возникновения важно, еще важнее сейчас – выяснить, как с новым штаммом можно бороться.