Сегодня зоопарк отмечает 161-ю годовщину со дня основания, его коллекция насчитывает более 1200 видов животных, что делает его мировым лидером по биоразнообразию. Среди обитателей зоопарка — редкие виды, находящиеся на грани исчезновения, такие как амурские леопарды и суматранские орангутаны.
В 2024 году зоопарк пополнился 300 новыми животными, представляющими 63 вида. Среди них — три малайских медвежонка Маша, Лучик и Звездочка, имена которым выбрали москвичи в рамках проекта «Активный гражданин». Также на экспозиции «Остров зверей» появились пятнистые гиены, а из зоопарка Алма-Аты прибыл черный гриф.
В Московском зоопарке содержится семья панд, в августе прошлого года родилась панда Катюша, имя которой выбирали всей Россией.
В рамках международного сотрудничества из Беларуси в зоопарк привезли двух зубров, что является частью программы по восстановлению их популяции. Кроме того, на подмосковной территории зоопарка приняли 37 собак из приютов Курской области, о которых заботятся сотрудники и волонтеры.