Генетическая характеристика изолята высоковирулентного вируса гриппа подтипа Н5N1, выявленного при вспышке ВПГП на территории Магаданской области в октябре 2022 года

Референтная лаборатория вирусных болезней птиц ФГБУ «ВНИИЗЖ» провела генетический анализ изолята вируса гриппа, вызвавшего вспышки ВПГП у домашней птицы в личном подсобном хозяйстве на территории Магаданской области в октябре 2022 года. При изучении патологического материала от трупов птиц был выявлен высоковирулентный вирус гриппа подтипа H5N1.
Результаты сравнительного генетического анализа нуклеотидных последовательностей фрагмента гена H показали, что изоляты вируса не отличаются друг от друга на изученном участке генома и принадлежат к азиатской генетической линии вируса высокопатогенного гриппа птиц подтипа H5, клада 2.3.4.4, получившего эпизоотическое распространение в 2016-2022 гг. в странах Азии, Европы, Африки и Северной Америки. Сайт расщепления гемагглютинина выявленного изолята имеет структуру -REKRRKR-, характерную для высоковирулентных вирусов гриппа птиц. Согласно данным международной базы GenBank, наиболее генетически близкими к выявленному изоляту являются вирусы подтипа H5N8, выделенные в Китае в 2021 году (уровень сходства 100%).
Изолят вируса гриппа птиц из Магаданской области генетически близок к вирусам гриппа птиц подтипа H5, выявленным в 2020 году в Челябинской, Омской, Курганской и Тюменской областях; в 2021 году в Челябинской, Кировской областях, Р. Тыва; в 2022 году в Московской, Рязанской, Самарской, Ростовской и Челябинской областях, Хабаровском крае (уровень сходства 99,6-100%).